Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATG2BQ96BY7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms