Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SPTSSAQ969W0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SPTSSAQ969W0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SPTSSAQ969W0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SPTSSAQ969W0 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SPTSSAQ969W0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SPTSSAQ969W0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SPTSSAQ969W0 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SPTSSAQ969W0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SPTSSAQ969W0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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