Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP2A3Q93084 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP2A3Q93084 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms