Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms