Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms