Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms