Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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BEST4Q8NFU0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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BEST4Q8NFU0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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BEST4Q8NFU0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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