Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
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