Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms