Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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SNX20Q7Z614 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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SNX20Q7Z614 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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SNX20Q7Z614 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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SNX20Q7Z614 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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SNX20Q7Z614 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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SNX20Q7Z614 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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SNX20Q7Z614 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX20Q7Z614 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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