Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDXQ7Z353 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms