Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms