Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms