Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TCF23Q7RTU1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms