Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
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