Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIF1Q5UIP0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms