Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCID2Q5JVF3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms