Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms