Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms