Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms