Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC27Q2M243 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms