Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms