Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HLFQ16534 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HLFQ16534 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HLFQ16534 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HLFQ16534 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HLFQ16534 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HLFQ16534 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HLFQ16534 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HLFQ16534 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HLFQ16534 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HLFQ16534 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
HLFQ16534 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HLFQ16534 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HLFQ16534 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HLFQ16534 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLFQ16534 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLFQ16534 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLFQ16534 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLFQ16534 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLFQ16534 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HLFQ16534 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLFQ16534 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLFQ16534 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLFQ16534 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLFQ16534 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLFQ16534 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLFQ16534 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLFQ16534 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLFQ16534 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLFQ16534 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLFQ16534 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLFQ16534 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLFQ16534 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLFQ16534 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HLFQ16534 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLFQ16534 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLFQ16534 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLFQ16534 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLFQ16534 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLFQ16534 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLFQ16534 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLFQ16534 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLFQ16534 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLFQ16534 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLFQ16534 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLFQ16534 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLFQ16534 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLFQ16534 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLFQ16534 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLFQ16534 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLFQ16534 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLFQ16534 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLFQ16534 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLFQ16534 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLFQ16534 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLFQ16534 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HLFQ16534 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLFQ16534 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLFQ16534 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLFQ16534 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HLFQ16534 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLFQ16534 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLFQ16534 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLFQ16534 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLFQ16534 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLFQ16534 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLFQ16534 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLFQ16534 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HLFQ16534 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLFQ16534 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms