Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
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