Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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ZNF56Q15929 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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ZNF56Q15929 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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ZNF56Q15929 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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ZNF56Q15929 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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ZNF56Q15929 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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ZNF56Q15929 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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ZNF56Q15929 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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ZNF56Q15929 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
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