Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms