Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
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