Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms