Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms