Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FRMPD4Q14CM0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms