Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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CHD4Q14839 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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CHD4Q14839 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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CHD4Q14839 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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CHD4Q14839 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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CHD4Q14839 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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