Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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