Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms