Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms