Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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TOP3AQ13472 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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TOP3AQ13472 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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