Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms