Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRSQ13332 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRSQ13332 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms