Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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