Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNMA1Q12791 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.1 ms