Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms