Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LOXL1Q08397 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LOXL1Q08397 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LOXL1Q08397 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LOXL1Q08397 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LOXL1Q08397 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LOXL1Q08397 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LOXL1Q08397 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LOXL1Q08397 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LOXL1Q08397 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LOXL1Q08397 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LOXL1Q08397 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LOXL1Q08397 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LOXL1Q08397 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LOXL1Q08397 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LOXL1Q08397 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
LOXL1Q08397 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
LOXL1Q08397 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LOXL1Q08397 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LOXL1Q08397 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LOXL1Q08397 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms