Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGM3Q08188 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms