Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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TFF3Q07654 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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TFF3Q07654 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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TFF3Q07654 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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TFF3Q07654 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TFF3Q07654 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TFF3Q07654 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TFF3Q07654 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TFF3Q07654 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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