Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME1Q06323 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms