Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms