Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms