Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLCB3Q01970 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms