Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms