Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F1Q01094 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms