Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYBPC1Q00872 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms